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청주공항은 현재 일반 주차장 사전예약 서비스를 공식적으로 운영하지 않으며, 차량번호 자동인식 방식으로 입·출차가 진행된다. 대신 만차 시에는 공식 발렛주차 서비스 이용이 가능하며 일부 발렛 업체는 카카오T·카카오내비 앱을 통한 예약을 지원한다.
실시간 주차 현황은 청주공항 메인 홈페이지에서 확인 가능하며 제1~4주차장 잔여면수가 표시된다. 현재 기준으로 제4주차장 등 일부 구역은 여유 공간이 남아 있는 상태다.
주차요금은 제1·2주차장의 경우 소형차 기준 하루 최대 1만원이며, 제3·4주차장은 하루 최대 6000원으로 장기주차 시 가장 많이 이용된다. 최초 10분은 무료이고 이후 시간당 약 1000원 수준으로 계산된다.
할인 대상은 경차·장애인·국가유공자·다자녀가구·저공해차량 등이며 대부분 50% 할인, 저공해 3종은 20% 할인이 적용된다. 다자녀 할인은 사전등록 차량만 자동 적용되며 미등록 시 사후 환급 신청이 필요하다.
공식 발렛주차는 출국장 앞 접수장에서 차량을 맡기는 방식이며 일반적으로 주차요금과 발렛대행료가 별도 부과된다. 공식 발렛 이용 시 공항 주차요금의 40% 할인 혜택이 안내되고 있다.